Celosvětové oslavy jubilea zahájila hlava katolické církve o Vánocích roku 1999 otevřením Svaté brány a mší v bazilice svatého Petra. Otevření pravých dveří do hlavního chrámu ve Vatikánu a ve třech dalších římských bazilikách se koná jen na Svatý rok. Ten katolící slaví každých 25 let. Jinak jsou brány zazděné.
Čeští věřící zahájili Svatý rok na Pražském hradě a bohoslužbami ve všech ostatních katedrálách diecézních biskupů. Součástí oslav bylo v roce 1999 předání vánočního stromu z Beskyd papeži a také jarní národní pouť do Říma.
Jubilejní rok zakončí v katedrále v Praze pátého ledna vpodvečer biskup Jaroslav Škarvada. Podle mluvčího České biskupské konference Daniela Hermana proběhne podobné zakončení Velkého jubilea 5. nebo 6. ledna v rámci bohoslužeb oslavujících Tři krále po celé republice.
Křesťané slavili i poslední den roku, kdy se sešli v pražské katedrále svatého Víta k děkovným bohoslužbám. Podobně se sešli věřící i v dalších katolických kostelích a farnostech ostatních církví.